انفجار بمبی در شهر توکیو سال ۱۹۸۸ باعث نابودی کامل شهر و شروع جنگ جهانی سوم می‌شود. ۳۱ سال بعد شهر جدیدی به نام نئو ـ توکیو تاسیس می‌گردد. یکی از اعضای باند گانگستری موتورسواران بنام تتسو، پس از تصادف با یک نوجوان توسط نیروهای پلیس دستگیر می‌شود. در مرکز پلیس دانشمندان پی به نیروی تله پاتیک در تِتسو می شوند و تصمیم می گیرند از او به برای یافتن منبع نیروی فوق العاده مخربی به نام آکیرا که باعث تخریب شهر توکیو اصلی نیز شده است استفاده کنند...

داستان در یک دنیای زیرزمینی مخفی اتفاق می‌افتد. "پاتما"شاهزاده این دنیا دوست دارد به بیرون رفته و گردش کند. او بیش از همه به محلی به نام “منطقه خطر”می رود که هیچ کس اجازه ورود به آن را ندارد .